病历结构化

1客户嘴上要的

「医院要建科研数据平台。用大模型把十年的历史病历全部结构化，医生想研究什么就能查什么。」

这是症状或现成方案，不一定是真问题。下面看两种做法。

2照字面做，会怎么烂

3好 FDE 的实际走法

共 12 周，分 5 个阶段。带三角标记的是这一步最容易踩的坑。

1. 1–2

   第 1–2 周找一个真实课题

   • 跟科研处和 3 个临床科室主任各聊一次，找一个已经立项、正在缺数据的课题。选中心内科的心衰回顾性研究：研究生正在手工翻病历，填 30 个变量（射血分数、NT-proBNP、用药、再入院等），一份病历 40 分钟，要填 1500 份。
   • 真问题不是「全量结构化」，是「让这个课题的数据能被统计师直接用」。成功标准改成：30 个变量在 200 份标注病历上逐字段准确率 ≥ 95%；1500 份病历的数据整理从 3 个月压到 2 周。
   • 同一周找信息科：数据分散在 EMR（病程、出院小结）、LIS（检验）、超声报告系统，请信息科提院内取数和接口排期。
   • 踩坑不要从「平台」开始。没有具体用户的平台，没有人能验收。
2. 3–5

   第 3–5 周伦理审批 + 准备标注标准

   • 配合课题组向伦理委员会提交材料：研究方案、数据范围、去标识化方式、数据在院内处理不外传。这一步通常要 2–4 周，是医院项目比 6 周长的主要原因。
   • 等伦理的同时，和课题组定标注规范：每个变量的定义、取哪个时间点（如「入院 48 小时内首次检验值」）、多个值时取哪个。请 2 名住院医师独立标注 200 份病历，主治医师裁定分歧，作为标准答案。
   • 踩坑变量定义不清，标注员之间就对不上，模型更对不上。先让两个医生之间的一致率达标，再测模型。
3. 6–9

   第 6–9 周原型 + evals

   • 在院内服务器部署：检验值、用药等结构化数据直接从 LIS 和医嘱表取，不用模型；只有超声描述、病程记录里的信息才用大模型抽取。每个抽取值链接到原文段落。
   • evals：在 200 份标准答案上逐字段比对，低于 95% 的字段逐个分析错误原因，改提示词或改取数逻辑。
   • 踩坑同一个指标在不同年份的报告模板写法不同。测试集要按年份分层抽样，不能只抽最近两年。
4. 10

   第 10 周Demo + 研究生上手

   • 让课题组研究生本人用系统跑完 1500 份，对低置信度的值逐条复核。第一版复核界面只显示抽取值，研究生要自己去 EMR 里翻原文，一天只复核了 30 份；改成点一下就跳到原文段落后，一天能复核 150 份。
5. 11–12

   第 11–12 周交接交接

   • 交接给科研处一位数据管理员：负责新课题的变量定义和标注流程；信息科负责服务器和取数接口。写一页「新课题怎么接入」的流程：先定变量、过伦理、做标注，再跑模型。

4这个案例教给你的可复用判断